فذا البرنامج يهدف إلي إعداد خريج مُزود بالمهارات والقدرات التي تُؤهلة للمنافسة في سوق العمل علي الفرص المتاحة بمصانع المنتجات الغذائية والكيميائية والصناعية المعتمدة في إنتاجها علي الكائنات الحية أو مكوناتها. كما تؤهلة للعمل في معامل التحاليل، المستشفيات، بنوك الدم، مصلحة الطب الشرعي، هيئة المصل واللقاح، شركات الأدوية، فروع جهاز شئون البيئة، محطات معالجة المياة، الجامعات الحكومية و الخاصة، ومراكز البحوث المنتشرة بأنحاء الجمهورية.

والأهم من ذلك هو أن البرنامج يهدف إلي إعداد خريج مُدرب ومُجهز لتطبيق ما يدرسه في تأسيس مشروع خاص به من أجل إنتاج أوصناعة منتجات جديدة باستخدام تطبيقات التقنية الحيوية التي يدرسها بتعمق، ويتدرب عليها بكفاءة من خلال الدراسة النظرية والعملية والتدريب الميداني الذي يتلقاه على مدارالدراسة. 

صمم هذا البرنامج الدراسى بحيث يتم التعلم عن طريق المحاضرات والدروس العملية التطبيقية والتدريب فى المصانع ومراكز البحوث والمعامل الحكومية والخاصة فى مجال الميكروبيولوجية التطبيقية الى جانب حلقات النقاش واجراء مشاريع التخرج التطبيقية بالأضافة الى التعاون مع المجتمع الخارجى